176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0624 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0624  dihydroorotase  100 
 
 		 335 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.841331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1848  dihydroorotase  57.62 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.100177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0041  dihydroorotase  57.93 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2557  dihydroorotase  57.62 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0309  dihydroorotase  58.33 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311642  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0286  dihydroorotase  57.7 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1722  dihydroorotase  57.7 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.798231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2027  dihydroorotase  55.05 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0190  dihydroorotase  54.13 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1778  dihydroorotase  50.77 
 
 		 327 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  38.37 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  41.5 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  42.77 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  40.99 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  41 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  40.47 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  38.66 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  38.66 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  39.83 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  39.18 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  40.87 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  39.94 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  39.83 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  39.94 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  40.12 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  38.89 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  39.41 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  39.2 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  40.87 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  40.52 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  38.66 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  39.2 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  39.53 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  39.53 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  39.53 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  40.23 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  41.16 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  40.41 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  38.78 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  39.12 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  39.94 
 
 		 378 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  42.11 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  38.82 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  38.82 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  38.71 
 
 		 344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  40.41 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  39.12 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  40.12 
 
 		 343 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  39.71 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  40.23 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  39.71 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  39.13 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  40.12 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  39.13 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  39.13 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  39.13 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  39.19 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  39.5 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  39.36 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  39.53 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  39.24 
 
 		 348 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  40.06 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  38.82 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  41.07 
 
 		 345 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  39.24 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  38.17 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  38.64 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  39.65 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  38.84 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  39.94 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  39.31 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  39.65 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  38.73 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  38.87 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  38.24 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  37.54 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  38.3 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  38.82 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  37.86 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  39.65 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3035  dihydroorotase  38.73 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2893  dihydroorotase  38.73 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  36.63 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  38.66 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  38.24 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  38.95 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  38.53 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  38.87 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  38.15 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  39.75 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  37.76 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  38.53 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  38.28 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  37.94 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  38.33 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>