117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1876 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1876  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1869  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  85.96 
 
 
235 aa  358  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0225  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  55.51 
 
 
232 aa  244  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16090  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  53.07 
 
 
235 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  56.16 
 
 
232 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  53.48 
 
 
239 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  50.23 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10840  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  51.36 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00558834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  39.91 
 
 
220 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1373  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.68 
 
 
217 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341199  normal  0.244006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  37.12 
 
 
222 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.24 
 
 
220 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  36.28 
 
 
220 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1969  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1330  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  37.75 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.92 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.16 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  28 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.5 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.37 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.57 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.01 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.79 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.97 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.5 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.33 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  25.33 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.33 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.49 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  28.72 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.96 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  28.65 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  23.04 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.56 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  31.34 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.1 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  26.8 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  22.75 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.97 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  28.65 
 
 
191 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.97 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.4 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.97 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.22 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.95 
 
 
188 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  24.51 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.23 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  27.63 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  27.63 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.09 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  25.71 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  25.71 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.89 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  28.95 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  23.04 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  22.89 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  29.55 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  24.63 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.89 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.98 
 
 
203 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.86 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.06 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  26.11 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  28.87 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.79 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.94 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.32 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.32 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.61 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.32 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.08 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.42 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
239 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  25.44 
 
 
239 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
239 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
234 aa  52  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
234 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
239 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
234 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  25.44 
 
 
239 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  28.86 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.86 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  28.57 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.86 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.55 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  23.79 
 
 
202 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  26.6 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.78 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.67 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.04 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  18.03 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  24.85 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  24.85 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.85 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.35 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.95 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.95 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0793  protein PnuC  24.85 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000546447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>