26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1424 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1424  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0916527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1388  hypothetical protein  95.45 
 
 
66 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.905929  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4184  hypothetical protein  57.58 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.578507  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3297  hypothetical protein  53.03 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1493  hypothetical protein  54.55 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3526  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.839258  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0665  hypothetical protein  51.52 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1218  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114739  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0802  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1114  hypothetical protein  53.7 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.377277  normal  0.142186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2214  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2338  hypothetical protein  51.79 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3995  hypothetical protein  48.48 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00216255  normal  0.238179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1241  hypothetical protein  46.43 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3920  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1461  hypothetical protein  46.3 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000951069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1459  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2452  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307643  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23210  hypothetical protein  44.64 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  0.0901448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1040  hypothetical protein  41.27 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3983  hypothetical protein  43.86 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262413  normal  0.447927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27830  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0214542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2402  hypothetical protein  43.86 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0371811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2176  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.572915  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2130  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2117  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449177  normal  0.11151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>