More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0290 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0290  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0334  two component transcriptional regulator  91.29 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8335  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  36.32 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  37.57 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1373  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  34.31 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.28 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  37.5 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  37.28 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  38.16 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.47 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.47 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  35.52 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  35.52 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  31.88 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3253  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  36.11 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  35.33 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  32.75 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  37.58 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  29.91 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.36 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  37.09 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.61 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  37.75 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4261  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  38.41 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  28.25 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  33.52 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  36.52 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.42 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  30.88 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  36.42 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  36.42 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.93 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  32.6 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.09 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30.88 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 224 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2486  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.28 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.1 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  32.49 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.1 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0959  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.44 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.159493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.84 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.66 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  31.39 
 
 		 223 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.05 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.1 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  33.15 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  32.83 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  32.78 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4602  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.46 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>