19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0063 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0063  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1421    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155686  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.68 
 
 
558 aa  89  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.52 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.14 
 
 
1328 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.84 
 
 
519 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1654  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.6 
 
 
1046 aa  47.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.42759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  25.53 
 
 
794 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  24.3 
 
 
819 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.12 
 
 
519 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.73 
 
 
517 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  25.53 
 
 
794 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  23.99 
 
 
822 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  23.99 
 
 
822 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  23.99 
 
 
822 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  23.99 
 
 
822 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  23.84 
 
 
768 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  23.84 
 
 
768 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  23.84 
 
 
768 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.57 
 
 
1446 aa  43.9  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>