More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0043 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0043  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0008  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00012117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0061  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0043  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0011  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0068  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2517  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00884396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2527  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2528  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0071  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0090  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2221  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2231  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2232  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0056  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0050  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0035  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0289438  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0044  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243599  hitchhiker  0.00307567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>