96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4158 on replicon NC_013518
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013518  Sterm_4158  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  29.25 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  27.59 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  24.09 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  32.06 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  31.11 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  31.91 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29.85 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  29.49 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  29.25 
 
 
296 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  29.86 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  25.42 
 
 
285 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  29.23 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  28.79 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.26 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  27.87 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  29.58 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  30.26 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  30 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  25.97 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  31.62 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  29.24 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  29.86 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  30.47 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  28.42 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  26.53 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  30.23 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  26.47 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  24.86 
 
 
324 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  28.91 
 
 
292 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  28.91 
 
 
292 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.88 
 
 
272 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  28.91 
 
 
292 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  24.3 
 
 
302 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  28.91 
 
 
292 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  32.35 
 
 
682 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  29.01 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  26.87 
 
 
422 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  31.78 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  26.57 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  29.34 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  25.14 
 
 
311 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  25.11 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  31.62 
 
 
684 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  27.33 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  35.56 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  26.55 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  22.07 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  27.61 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.25 
 
 
684 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  29.44 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  28.91 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  26.28 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  26.95 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.67 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  29.46 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  30.23 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  25.14 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  26.98 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  26.45 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  28.68 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  23.08 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  28.47 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  29.17 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  25.29 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  26.52 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  27.27 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  24.49 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  27.12 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  28.68 
 
 
683 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  26.92 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  28.12 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  26.87 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  26.72 
 
 
310 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  26.13 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  25.18 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  28.67 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  26.97 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  28.12 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  25.95 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  32.97 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  22.95 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  26.04 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  29.03 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  27.91 
 
 
681 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.97 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  27.94 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.32 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>