22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2975 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2975  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.53 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0575  hypothetical protein  21.01 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000185877  normal  0.010327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0006  2-alkenal reductase  28.37 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  25.93 
 
 
484 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  28.21 
 
 
502 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  31.33 
 
 
474 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  28.57 
 
 
499 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  33.73 
 
 
483 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  27.91 
 
 
485 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  27.5 
 
 
500 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.67 
 
 
452 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  26.19 
 
 
503 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  27.27 
 
 
499 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.95 
 
 
459 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  34.44 
 
 
513 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  21.74 
 
 
464 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  26.19 
 
 
503 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  26.6 
 
 
501 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  26.19 
 
 
502 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  26.19 
 
 
502 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  26.19 
 
 
502 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>