39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2888 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2888  Resolvase domain protein  100 
 
 
469 aa  948    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.14 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.58 
 
 
548 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.92 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.92 
 
 
542 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.14 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  24.07 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.54 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.91 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  30.93 
 
 
549 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  22.03 
 
 
539 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  22.03 
 
 
568 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
586 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  21.25 
 
 
525 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.11 
 
 
496 aa  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  21.45 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  21.45 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 
211 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.43 
 
 
563 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  20.77 
 
 
449 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.98 
 
 
558 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  22.71 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.53 
 
 
552 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  21.41 
 
 
641 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.92 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.43 
 
 
535 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.44 
 
 
222 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.71 
 
 
272 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  21.78 
 
 
524 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.67 
 
 
544 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  20.84 
 
 
509 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  34.44 
 
 
209 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  26.28 
 
 
196 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 
580 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.13 
 
 
510 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.44 
 
 
222 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  28.24 
 
 
524 aa  43.9  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 
252 aa  43.5  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>