222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2094 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2094  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.32 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  27.05 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.51 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.05 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.81 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.88 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003760  glucose repressor HexR for Entner-Doudoroff pathway RpiR family  23.28 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.56 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.48 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4203  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.16 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  21.78 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.09 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  21.58 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.3 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  27.65 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  30.34 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1021  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.79 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1059  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.79 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.29 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1019  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.79 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.64 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.15 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2069  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.23 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000131353  hitchhiker  0.000414379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.46 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.9 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.15 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.15 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.15 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23060  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.9 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612438 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.15 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1119  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.91 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.56 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1299  Hex regulon repressor  24.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.776105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  20.52 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.77 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.77 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.3 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.51 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.54 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  27.93 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3144  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.07 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0232322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  18.26 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.27 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.22 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.68 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  24 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  24 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  22.91 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  21.05 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  19.63 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  20.8 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  22.17 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  20.86 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  23.48 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  20.94 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.07 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  26.15 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  22.99 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01243  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.7 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  22.22 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1835  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.3 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  21.59 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  20 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6622  transcriptional regulator, RpiR family  21.22 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360305  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  21.1 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.8 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  18.86 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.56 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  18.14 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1901  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.38 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.25 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>