More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1165 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1165  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 
348 aa  689    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1369  cell shape determining protein MreB/Mrl  59.94 
 
 
352 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  47.29 
 
 
346 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  45.35 
 
 
348 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  44.25 
 
 
343 aa  308  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  43.48 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  46.18 
 
 
342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  46.47 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  45.65 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  43.95 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  45.56 
 
 
348 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  44.48 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.87 
 
 
344 aa  305  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
347 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
347 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  42.61 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  46.25 
 
 
342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.67 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  44.03 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  44.48 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  45.95 
 
 
342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  45.73 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  44.61 
 
 
347 aa  302  7.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
347 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  44.05 
 
 
347 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  44.05 
 
 
347 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  43.58 
 
 
347 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  43.24 
 
 
340 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
339 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  44.38 
 
 
354 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  44.51 
 
 
358 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.17 
 
 
339 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  45.67 
 
 
344 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  44.51 
 
 
339 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  43.98 
 
 
368 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  43.36 
 
 
343 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  43.47 
 
 
339 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  43.62 
 
 
340 aa  299  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  43.47 
 
 
339 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
338 aa  298  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  43.52 
 
 
348 aa  298  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.38 
 
 
350 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  42.32 
 
 
347 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  42.32 
 
 
347 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 
345 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  46.27 
 
 
345 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  44.22 
 
 
358 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
343 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  42.9 
 
 
346 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  43.92 
 
 
349 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  42.94 
 
 
346 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  44.05 
 
 
347 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  43.79 
 
 
343 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  41.19 
 
 
342 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  42.47 
 
 
344 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  43.53 
 
 
349 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  45.35 
 
 
343 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  42.32 
 
 
347 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  42.57 
 
 
347 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.77 
 
 
345 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  43.11 
 
 
348 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  44.85 
 
 
340 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  43.07 
 
 
343 aa  295  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  44 
 
 
347 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 
345 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 
345 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 
345 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  42.32 
 
 
347 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 
345 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 
345 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 
345 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 
345 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 
345 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 
345 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  44.2 
 
 
347 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
347 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>