44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2720 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2720  Resolvase helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
105 aa  206  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0576266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2479  resolvase helix-turn-helix domain protein  80 
 
 
298 aa  164  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.883551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  30.68 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.68 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  30.68 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  30.68 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  30.68 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1193  transposase IS3/IS911 family protein  39.44 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.062228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  28.89 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  28.89 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  28.89 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  28.89 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  28.89 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  36.67 
 
 
754 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  38.3 
 
 
160 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1060  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0393  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0457  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0464  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1309  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1379  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0494281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1426  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1464  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  29.11 
 
 
365 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  29.21 
 
 
366 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1477  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1491  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.050946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1616  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.091531  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1065  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.73558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1620  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0925  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.160138  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0918  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0807  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0803  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0747  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0682  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0349  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00431305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0276  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2861  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2448  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2038  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1911  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1736  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1632  transposase  32 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>