253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3378 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3378  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000747392  hitchhiker  0.00551238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3549  deoxyribose-phosphate aldolase  94.16 
 
 		 257 aa  497  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0216784  hitchhiker  0.0000418325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2815  deoxyribose-phosphate aldolase  92.61 
 
 		 257 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00272907  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3048  deoxyribose-phosphate aldolase  88.72 
 
 		 257 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000145781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2822  deoxyribose-phosphate aldolase  87.55 
 
 		 256 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0142613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1102  deoxyribose-phosphate aldolase  87.16 
 
 		 256 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0215015  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3366  deoxyribose-phosphate aldolase  86.77 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0201919  hitchhiker  0.00182556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1217  deoxyribose-phosphate aldolase  86.38 
 
 		 256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3230  deoxyribose-phosphate aldolase  86.77 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000791533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1037  deoxyribose-phosphate aldolase  86.77 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000255358  hitchhiker  0.00000000038702 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1002  deoxyribose-phosphate aldolase  85.21 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000944927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1041  deoxyribose-phosphate aldolase  86.38 
 
 		 256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000759939  hitchhiker  0.0000000245827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3227  deoxyribose-phosphate aldolase  86.77 
 
 		 256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.178533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1140  deoxyribose-phosphate aldolase  86.77 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121446  hitchhiker  0.000000000107327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1025  deoxyribose-phosphate aldolase  84.44 
 
 		 258 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0327864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  85.6 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.048409  hitchhiker  0.000997229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002629  deoxyribose-phosphate aldolase  70.27 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0982616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1929  deoxyribose-phosphate aldolase  69.5 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03377  deoxyribose-phosphate aldolase  69.88 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3333  deoxyribose-phosphate aldolase  68.95 
 
 		 259 aa  340  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1972  deoxyribose-phosphate aldolase  63.81 
 
 		 257 aa  337  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0541  deoxyribose-phosphate aldolase  67.86 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0660  deoxyribose-phosphate aldolase  69.62 
 
 		 259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3498  deoxyribose-phosphate aldolase  70.64 
 
 		 265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0831  deoxyribose-phosphate aldolase  70.64 
 
 		 265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3627  deoxyribose-phosphate aldolase  70.21 
 
 		 265 aa  334  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0619  deoxyribose-phosphate aldolase  67.95 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4930  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04257  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.707451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04223  hypothetical protein  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3675  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.635596  normal  0.0472404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4616  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5896  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4980  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3617  deoxyribose-phosphate aldolase  69.92 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4923  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4928  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4982  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4821  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4889  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4975  deoxyribose-phosphate aldolase  69.49 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0599  deoxyribose-phosphate aldolase  66.8 
 
 		 259 aa  321  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2862  deoxyribose-phosphate aldolase  65.95 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3452  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0831  deoxyribose-phosphate aldolase  57.53 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4176  deoxyribose-phosphate aldolase  53.85 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0410  deoxyribose-phosphate aldolase  53.52 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4464  deoxyribose-phosphate aldolase  52.63 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.45684  normal  0.484684 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2811  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2666  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1068  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0110  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1271  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0130  deoxyribose-phosphate aldolase  54.92 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0264  deoxyribose-phosphate aldolase  49.22 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3147  deoxyribose-phosphate aldolase  48.16 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0640  deoxyribose-phosphate aldolase  46.69 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3924  deoxyribose-phosphate aldolase  46.12 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  0.560793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2186  deoxyribose-phosphate aldolase  44.35 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.446123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0140  deoxyribose-phosphate aldolase  44.35 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0839  deoxyribose-phosphate aldolase  39.06 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000295758  decreased coverage  0.000077294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3191  deoxyribose-phosphate aldolase  46.96 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2965  deoxyribose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  40.52 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000205356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0363  deoxyribose-phosphate aldolase  42.17 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  39.53 
 
 		 351 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0743  deoxyribose-phosphate aldolase  41.13 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3271  deoxyribose-phosphate aldolase  39.84 
 
 		 328 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4652  deoxyribose-phosphate aldolase  39.33 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3016  deoxyribose-phosphate aldolase  39.76 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0930267  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2232  deoxyribose-phosphate aldolase  39.33 
 
 		 327 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0991919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3528  deoxyribose-phosphate aldolase  41.06 
 
 		 324 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0208  deoxyribose-phosphate aldolase  42.11 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05510  deoxyribose-phosphate aldolase  40.89 
 
 		 317 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0789  deoxyribose-phosphate aldolase  38.04 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3249  deoxyribose-phosphate aldolase  40.49 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0777  Deoxyribose-phosphate aldolase  40.24 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1399  deoxyribose-phosphate aldolase  38.43 
 
 		 336 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61762  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5196  deoxyribose-phosphate aldolase  38.06 
 
 		 336 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3897  deoxyribose-phosphate aldolase  38.08 
 
 		 314 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0828  deoxyribose-phosphate aldolase  38.13 
 
 		 336 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0758191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0850  deoxyribose-phosphate aldolase  42.11 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  38.4 
 
 		 329 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.259546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1275  deoxyribose-phosphate aldolase  37.69 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.085183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2280  deoxyribose-phosphate aldolase  38.95 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0314  deoxyribose-phosphate aldolase  38.67 
 
 		 333 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3471  deoxyribose-phosphate aldolase  37.5 
 
 		 324 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7828  putative deoxyribose-phosphate aldolase (DERA)  39.47 
 
 		 328 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3739  deoxyribose phosphate aldolase  37.11 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1349  deoxyribose-phosphate aldolase  39.75 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3349  ribokinase  37.5 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2837  deoxyribose-phosphate aldolase  37.11 
 
 		 319 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0799  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 		 313 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4631  deoxyribose-phosphate aldolase  38.2 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698385  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2688  deoxyribose-phosphate aldolase  37.11 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4390  deoxyribose-phosphate aldolase  38.25 
 
 		 337 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.619878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1996  deoxyribose-phosphate aldolase  35.44 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.734647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1608  hypothetical protein  32.23 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1388  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  33.01 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>