15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3110 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1572  hypothetical protein  64.98 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1314  hypothetical protein  56.57 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3276  hypothetical protein  52.94 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1150  hypothetical protein  54.93 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1248  hypothetical protein  51.9 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3129  hypothetical protein  54.49 
 
 		 314 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.161074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1392  hypothetical protein  54.49 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.829307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1318  hypothetical protein  53.23 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2985  hypothetical protein  53.16 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1298  hypothetical protein  52.73 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2633  hypothetical protein  52.81 
 
 		 314 aa  316  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2971  hypothetical protein  52.82 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0837485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2340  hypothetical protein  47.33 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1280  hypothetical protein  47.06 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.483733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>