87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2116 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  347  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0234268  normal  0.096624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2280  hypothetical protein  73.49 
 
 		 165 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2372  hypothetical protein  72.94 
 
 		 160 aa  248  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0770  hypothetical protein  67.25 
 
 		 171 aa  231  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2123  hypothetical protein  54.21 
 
 		 194 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2109  hypothetical protein  52.38 
 
 		 193 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1749  hypothetical protein  52.28 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.286111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2236  hypothetical protein  60.65 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.664941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2352  hypothetical protein  73.55 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1743  hypothetical protein  54.17 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06613  hypothetical protein  55.22 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0618  hypothetical protein  53.79 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.58372  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001497  hypothetical protein  57.14 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2951  hypothetical protein  47.02 
 
 		 207 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3084  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3622  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4218  hypothetical protein  51.38 
 
 		 137 aa  121  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06650  hypothetical protein  52.11 
 
 		 72 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0628  hypothetical protein  56.25 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00226969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0378  hypothetical protein  49.3 
 
 		 81 aa  84.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2827  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  84  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1412  hypothetical protein  51.43 
 
 		 71 aa  84  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3042  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.132627  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0341  Protein of unknown function DUF2132  50 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.051948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2436  hypothetical protein  53.12 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00639773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1959  hypothetical protein  51.47 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.828133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2504  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  0.0140198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2434  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  hitchhiker  0.00140537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1610  hypothetical protein  43.18 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2444  hypothetical protein  53.12 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.035682  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0593  hypothetical protein  51.43 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0923126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2596  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.362148  hitchhiker  0.00128631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0890  hypothetical protein  47.95 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001137  hypothetical protein  50.7 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1693  hypothetical protein  44.83 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.010158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2687  hypothetical protein  44.83 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377481  hitchhiker  0.00029816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1546  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.819607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2614  hypothetical protein  47.89 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1449  hypothetical protein  40.62 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1656  hypothetical protein  43.68 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0143793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.033963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1671  hypothetical protein  47.22 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.191799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1862  Protein of unknown function DUF2132  53.12 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.111787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1541  hypothetical protein  53.12 
 
 		 81 aa  77  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.455929  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00756  hypothetical protein  45.71 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6012  hypothetical protein  51.67 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1422  hypothetical protein  46.38 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3456  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.734318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03420  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1391  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0089  hypothetical protein  46.97 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3149  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.895069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1279  hypothetical protein  44.78 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1277  hypothetical protein  36.05 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.302152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1318  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4358  hypothetical protein  50.79 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1619  hypothetical protein  48.39 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00951066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3651  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4274  hypothetical protein  50.79 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1447  hypothetical protein  50.79 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302055  normal  0.30283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1649  hypothetical protein  46.27 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2925  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2838  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3929  hypothetical protein  42.65 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0545  hypothetical protein  46.27 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.941544  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0938  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.234325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1431  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1359  hypothetical protein  44.62 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4356  hypothetical protein  43.28 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0132  hypothetical protein  47.06 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00577165  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1023  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1255  hypothetical protein  42.47 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000449725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4258  hypothetical protein  48.48 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50000  hypothetical protein  47.54 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0489266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3441  hypothetical protein  37.66 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1084  hypothetical protein  48.39 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2029  hypothetical protein  42.65 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4195  hypothetical protein  45.9 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4575  hypothetical protein  47.06 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2062  hypothetical protein  39.73 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000656524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3339  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2357  Protein of unknown function DUF2132  41.18 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1251  hypothetical protein  43.08 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814081  normal  0.429328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3518  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1066  hypothetical protein  41.18 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2243  hypothetical protein  37.14 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000173706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>