66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1506 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3163  hypothetical protein  95.83 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2740  hypothetical protein  92.5 
 
 		 124 aa  240  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1442  hypothetical protein  87.5 
 
 		 120 aa  225  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1709  hypothetical protein  85.83 
 
 		 121 aa  226  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1363  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1738  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2718  hypothetical protein  83.33 
 
 		 120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1362  hypothetical protein  85 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2618  hypothetical protein  83.33 
 
 		 120 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2551  hypothetical protein  83.33 
 
 		 120 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1543  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1547  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1577  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2803  hypothetical protein  84.17 
 
 		 120 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.667341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1176  hypothetical protein  82.88 
 
 		 118 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0511  hypothetical protein  69.52 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0468  hypothetical protein  69.52 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0448  hypothetical protein  69.52 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0457  hypothetical protein  69.52 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0451  hypothetical protein  69.52 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1298  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  153  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0247064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1668  HNH endonuclease  61.61 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.843444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2455  hypothetical protein  67.62 
 
 		 115 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1061  hypothetical protein  62.28 
 
 		 119 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3223  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  hitchhiker  0.00000116021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0444  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0329  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.443083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0492  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.788457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00362  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.308239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0440  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0480  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00358  hypothetical protein  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3199  HNH endonuclease  68.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00688209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1378  hypothetical protein  66.67 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3913  hypothetical protein  59.2 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.779122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1572  hypothetical protein  59.2 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.0102998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1396  hypothetical protein  61.74 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1305  hypothetical protein  60.53 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4584  hypothetical protein  60.53 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4107  hypothetical protein  60.53 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1247  hypothetical protein  67.65 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3893  hypothetical protein  59.65 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1881  hypothetical protein  63.16 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3445  hypothetical protein  64.76 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1678  hypothetical protein  64.76 
 
 		 114 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3298  hypothetical protein  63.81 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.989077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2803  hypothetical protein  61.9 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1349  hypothetical protein  61.9 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.0379212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2881  hypothetical protein  61.9 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1697  hypothetical protein  64.08 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.753726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2288  hypothetical protein  57.39 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3688  hypothetical protein  59.43 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2451  HNH endonuclease  61.62 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449556  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1778  hypothetical protein  55.65 
 
 		 116 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.539869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17990  HNH endonuclease domain-containing protein  58.82 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0839  HNH endonuclease  47.58 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0922  HNH endonuclease  51.69 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2881  HNH endonuclease  55.75 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0915  HNH endonuclease  52.33 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3568  HNH endonuclease  51.25 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0691  HNH endonuclease  51.06 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000791795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1250  HNH endonuclease  54.65 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0702  HNH endonuclease  51.06 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000397856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1211  hypothetical protein  65.57 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0661849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2816  HNH endonuclease  58.73 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>