87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1322 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1031  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  89.36 
 
 		 376 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3164  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.43 
 
 		 376 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.96 
 
 		 376 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.69 
 
 		 376 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2985  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.43 
 
 		 376 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.733812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1026  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.96 
 
 		 376 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1221  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  93.62 
 
 		 377 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1093  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.69 
 
 		 376 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1322  glutaconyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 376 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0119077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1200  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  93.62 
 
 		 376 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1127  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.96 
 
 		 376 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3335  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  94.95 
 
 		 376 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3265  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  90.69 
 
 		 376 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1053  oxaloacetate decarboxylase  86.97 
 
 		 376 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3375  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  83.51 
 
 		 376 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3011  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  80.85 
 
 		 376 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03490  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  80.32 
 
 		 376 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0086  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  80.32 
 
 		 376 aa  588  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.923092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002526  oxaloacetate decarboxylase beta chain  80.05 
 
 		 376 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02840  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  80.05 
 
 		 376 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0640  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  80.05 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1050  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  77.93 
 
 		 377 aa  577  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1741  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  81.38 
 
 		 376 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3197  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.28 
 
 		 379 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1201  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  70.21 
 
 		 516 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0917  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.99 
 
 		 519 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1266  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  71.43 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2479  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  73.07 
 
 		 375 aa  501  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0809  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.15 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.61044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3622  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  69.61 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000349445  hitchhiker  0.000000446411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2892  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  65.87 
 
 		 378 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0351319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0064  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  68.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000825924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1258  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase biotin carboxyl carrier subunit alpha  66.48 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.913134  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0605  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  65.6 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1492  glutaconyl-CoA decarboxylase beta subunit  63.96 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0159163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1850  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  63.2 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0319  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  59.58 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1307  oxaloacetate decarboxylase  63.13 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0998305  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0694  oxaloacetate decarboxylase  70.98 
 
 		 440 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0972  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  70.59 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0203  oxaloacetate decarboxylase beta subunit  61.5 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0895  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  59.48 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0058  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  59.25 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0061  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.48 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0804  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.72 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  58.78 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.132607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0832  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.25 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.02 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.566525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3614  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.02 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3711  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.48 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0863  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.48 
 
 		 433 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3542  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.48 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.069232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3649  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  59.02 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0060  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.25 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3543  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.02 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2434  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  60.44 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3692  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  57.61 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0886  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.99 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0953  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.28 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.126318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1366  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.38 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0970763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1434  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  54.69 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3585  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.34 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.330233  normal  0.310791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0996  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.15 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1820  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.35 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1666  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.69 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0944  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.65 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0294  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.33 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3314  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.59 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1608  methylmalonyl-CoA decarboxylase, beta subunit  55.73 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0382  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.98 
 
 		 385 aa  359  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.159911  normal  0.654104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2282  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.97 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1275  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.34 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3673  glutaconyl-CoA decarboxylase  51.05 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.523011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.15 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.15 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1898  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  46.48 
 
 		 378 aa  338  8e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0509  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.54 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1310  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.95 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0204  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.1 
 
 		 554 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.928975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1925  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.8 
 
 		 380 aa  318  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0241  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.53 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.140679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1756  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  40.06 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1320  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  30.18 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1055  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.65 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3300  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  30.19 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3311  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  32.69 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2305  pyruvate carboxyltransferase  72.73 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>