11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0309 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000322809  hitchhiker  0.000000114603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0324  hypothetical protein  55.06 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0326  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0679821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0334  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.706476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0331  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4384  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0430  hypothetical protein  55.07 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0334  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3692  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0325  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3395  hypothetical protein  38.06 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>