15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0134 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0097  hypothetical protein  80.11 
 
 		 181 aa  298  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4085  hypothetical protein  70.52 
 
 		 178 aa  248  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4307  hypothetical protein  63.69 
 
 		 180 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4447  hypothetical protein  63.69 
 
 		 180 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0092  hypothetical protein  63.13 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4252  hypothetical protein  63.13 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3673  hypothetical protein  65.9 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3864  hypothetical protein  63.13 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3957  hypothetical protein  63.13 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0134  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1476  hypothetical protein  42.2 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1538  hypothetical protein  34.71 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2394  major facilitator superfamily permease  32.95 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1705  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>