95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4825 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4825  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1859  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  83.06 
 
 		 271 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2661  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  74.7 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4497  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  70.66 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1137  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  71.65 
 
 		 262 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.126755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2589  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  70.8 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0506  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  68.67 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04390  soluble hydrogenase delta subunit, HoxY  68.4 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3428  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  67.63 
 
 		 252 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897709  normal  0.335776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3480  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  67.63 
 
 		 252 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3417  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  67.63 
 
 		 252 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.287071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1018  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  65.08 
 
 		 277 aa  332  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0184891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3473  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  64.23 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1262  hypothetical protein  47.73 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.484653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2533  hypothetical protein  49.39 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2388  hypothetical protein  48.58 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0938  [NiFe] hydrogenase, delta subunit, putative  48.21 
 
 		 265 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1056  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.21 
 
 		 265 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.688665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1969  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.92 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1123  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.82 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2248  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.75 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2604  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.45 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0244  hydrogenase/sulfur reductase, delta subunit  35.46 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.217236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2498  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.76 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1928  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.92 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0081  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.33 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.242431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2131  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.34 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0141674  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2096  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.47 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2168  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  34.44 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1255  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.54 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0883  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  32.37 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1008  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.38 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0976  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.04 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.313048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2014  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.08 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1214  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.45 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1711  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.47 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.47 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0651  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  26.64 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.907295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0997  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  27.43 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3679  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.63 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0071  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  24.59 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0614  hydrogenase, group 3, VhuG subunit, putative  27.27 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.773338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1652  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  26.44 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0587  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  26.94 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000383981  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_552  nickel-dependent hydrogenase, group 3, small subunit  26.26 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000367769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3536  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.24 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0098  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  23.77 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4293  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  24.72 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4315  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  24.54 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2477  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.76 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.48758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2259  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.55 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4307  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  24.62 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.340367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.95 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.720565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4163  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.63 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1792  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  24.18 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2792  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.45 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0379698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3955  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  26.3 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4163  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  23.31 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3540  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.06 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4659  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.98 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2222  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  28.79 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.48107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1367  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.22 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1552  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.76 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1216  hydrogen dehydrogenase  24.4 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0473732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1672  hydrogen dehydrogenase  27.59 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2749  Hydrogen dehydrogenase  27.47 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3885  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.16 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3973  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.58 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000410627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3856  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.65 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1460  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.19 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4046  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  27.33 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.586699  normal  0.0266692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1112  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  28.32 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.668315  normal  0.471993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4256  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.19 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.359496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0981  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  23.03 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4114  hydrogen dehydrogenase  23.76 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122624  normal  0.234793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0530  hydrogen dehydrogenase  27.49 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2726  NAD-reducing hydrogenase, delta subunit  28.4 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0254891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1524  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  22.91 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000416432  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2249  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  23.81 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00641529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3319  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  24.78 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2418  nickel-dependent hydrogenase, small subunit, putative  24.68 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2556  NAD-reducing hydrogenase HoxS delta subunit  24.85 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2719  NAD-reducing hydrogenase, delta subunit  30.3 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0093  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.574923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0096  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0075  coenzyme F420 hydrogenase  27.01 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0077  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  22.29 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.919997  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1043  coenzyme F420 hydrogenase  26.88 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0647  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  25.29 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  27 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2101  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  22.16 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.656537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  26 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0629  coenzyme F420 hydrogenase  26 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.871927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1289  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  26 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2330  coenzyme F420 hydrogenase  30.21 
 
 		 262 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>