20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4411 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4411  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0253049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  46.75 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  43.33 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  45.33 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  40.58 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  31.65 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  32.39 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  37.68 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  35.44 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  35.44 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  29.11 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  45.1 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  31.94 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  36 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  36.92 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  35.94 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  32.88 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>