18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3762 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3762  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00916299  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2606  aminotransferase class IV  41.7 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04770  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.92 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  30.43 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.36 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  32.77 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  32.29 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.21 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  29.91 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.48 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  30.19 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  30.26 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  26.87 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  27.05 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  29.03 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.75 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>