More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3407  ABC transporter related protein  100 
 
 
246 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  59.91 
 
 
324 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  57.83 
 
 
319 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4171  ABC transporter related protein  58.41 
 
 
326 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1532  ABC transporter related protein  57.09 
 
 
333 aa  237  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  54.22 
 
 
321 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  56.28 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 
320 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2410  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  59.56 
 
 
320 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0120  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  57.83 
 
 
338 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0230448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1447  ABC transporter related protein  59.11 
 
 
319 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.65 
 
 
327 aa  221  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
338 aa  220  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.75 
 
 
327 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1957  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  57.02 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4201  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  57.52 
 
 
323 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.25 
 
 
323 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  53.78 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1447  ABC-type multidrug transport system ATPase component  55.31 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.767356  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.56 
 
 
334 aa  211  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
333 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  55.41 
 
 
321 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 
266 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3136  ABC transporter related protein  53.71 
 
 
332 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.67 
 
 
338 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
324 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44 
 
 
324 aa  207  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.11 
 
 
324 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
348 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.13 
 
 
308 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0095  ABC transporter related  52.4 
 
 
333 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.13 
 
 
308 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.33 
 
 
334 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
345 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.77 
 
 
312 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.11 
 
 
337 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  52.44 
 
 
320 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  48.35 
 
 
339 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  48.35 
 
 
339 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0867  hypothetical protein  53.33 
 
 
341 aa  205  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.229197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
333 aa  204  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.9 
 
 
328 aa  203  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
330 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 
330 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.9 
 
 
328 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
339 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
345 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.58 
 
 
325 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.19 
 
 
323 aa  202  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.8 
 
 
334 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.44 
 
 
325 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
329 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.49 
 
 
343 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 
326 aa  201  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.51 
 
 
360 aa  201  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  45.5 
 
 
304 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  49.1 
 
 
339 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  48.23 
 
 
337 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  48.58 
 
 
325 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 
327 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.64 
 
 
322 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.92 
 
 
326 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.22 
 
 
331 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
356 aa  198  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
323 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.46 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.3 
 
 
309 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.22 
 
 
330 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.13 
 
 
342 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  41.33 
 
 
338 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  52.4 
 
 
335 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.79 
 
 
324 aa  194  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.54 
 
 
339 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  40.5 
 
 
338 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.79 
 
 
325 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 
316 aa  194  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.96 
 
 
411 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.65 
 
 
279 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.13 
 
 
351 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.2 
 
 
345 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 
317 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  46.82 
 
 
339 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  47.75 
 
 
339 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.92 
 
 
334 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  47.06 
 
 
339 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
310 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.2 
 
 
338 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  52.04 
 
 
316 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3262  ABC transporter related  39.19 
 
 
320 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.11 
 
 
321 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  44.25 
 
 
337 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  52.7 
 
 
316 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  40.33 
 
 
260 aa  191  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.51 
 
 
354 aa  191  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
308 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3915  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 
327 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  40.91 
 
 
338 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>