71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3300 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3300  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  960    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.879747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3409  hypothetical protein  45.56 
 
 		 580 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  44.63 
 
 		 975 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  44.63 
 
 		 939 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8882  hypothetical protein  43.48 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0590  protein of unknown function DUF1555  38.95 
 
 		 235 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.579939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  43.33 
 
 		 3477 aa  70.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.11 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  45.56 
 
 		 2478 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  52 
 
 		 1222 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  52.38 
 
 		 1269 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  55.29 
 
 		 1269 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  44.09 
 
 		 1597 aa  61.6  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.16 
 
 		 892 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  43.21 
 
 		 2602 aa  60.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  39.29 
 
 		 1367 aa  60.1  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.99 
 
 		 850 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  37.01 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.27 
 
 		 1394 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.1 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  38.83 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 1268 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  36.56 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  42.35 
 
 		 4748 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.23 
 
 		 3474 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  51.32 
 
 		 1518 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  46.05 
 
 		 1879 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  51.19 
 
 		 2816 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1285 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.54 
 
 		 2839 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  33.58 
 
 		 4848 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  36.9 
 
 		 1363 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 4220 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  33.16 
 
 		 814 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  41.3 
 
 		 2267 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.86 
 
 		 2346 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 1287 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.23 
 
 		 4854 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.61 
 
 		 4978 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  50 
 
 		 1673 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 		 2114 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  35.96 
 
 		 3089 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  41.54 
 
 		 722 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  43.53 
 
 		 1672 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.5 
 
 		 2377 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 		 1712 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.66 
 
 		 846 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  37.5 
 
 		 891 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  34.04 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.74 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  34.51 
 
 		 2011 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.52 
 
 		 2039 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  43.33 
 
 		 886 aa  47  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  52 
 
 		 1884 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  38.37 
 
 		 991 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1781 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  39.56 
 
 		 1911 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.58 
 
 		 3544 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  42.05 
 
 		 1502 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  33.68 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  35.19 
 
 		 2040 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  38.37 
 
 		 570 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2330  hypothetical protein  29.27 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.865327  normal  0.0759502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  36.05 
 
 		 3793 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 		 2522 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  38.81 
 
 		 1022 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  33.33 
 
 		 653 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  56.25 
 
 		 3486 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 1286 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>