19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1574 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  66.39 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  61.54 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  54.39 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  54.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  54.24 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.72 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.39 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.28 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  45.22 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  48.57 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  46.6 
 
 		 239 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  38.66 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  36.94 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  41.03 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  31 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0207  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>