More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0182 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 		 205 aa  231  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  58.82 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  60.1 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  59.61 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  59.61 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.19 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  59.61 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.74 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.11 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  44.93 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  29.77 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.6 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.6 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.6 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.54 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  27.31 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  34.72 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  34.72 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  34.72 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  34.72 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.52 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.73 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  24.76 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  33.15 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  33.99 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.99 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.02 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.21 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  39.74 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0849  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.98 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.85 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.56 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  31.37 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  28.14 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.41 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  31.82 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.66 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.02 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.44 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.88 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  31.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  25.74 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.76 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.76 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>