23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3531 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3531  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  217  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324708  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3533  hypothetical protein  92.78 
 
 
97 aa  186  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0695575  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3536  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2220  hypothetical protein  39.78 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0180964  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1320  hypothetical protein  38.71 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00219631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1318  hypothetical protein  38.3 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2214  hypothetical protein  36.46 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2212  hypothetical protein  37 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.296364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2216  hypothetical protein  37.63 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.282607  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1392  hypothetical protein  36.17 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1390  hypothetical protein  36.56 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1322  hypothetical protein  35.48 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0836528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1328  hypothetical protein  36.25 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.37926  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2306  hypothetical protein  34.52 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2308  hypothetical protein  36.25 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.494683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2210  hypothetical protein  34.57 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1330  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1334  hypothetical protein  38.67 
 
 
186 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1400  hypothetical protein  38.67 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000229922  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1398  hypothetical protein  41.77 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526486  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1332  hypothetical protein  41.77 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000946516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1324  hypothetical protein  35.8 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0836528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2305  hypothetical protein  38.33 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.393122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>