More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3492 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  64 
 
 
1049 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.38 
 
 
1037 aa  1137    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  61.13 
 
 
1034 aa  846    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  59.58 
 
 
1037 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  59.58 
 
 
1037 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.98 
 
 
1034 aa  844    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  79.38 
 
 
1037 aa  1137    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  64 
 
 
1049 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.85 
 
 
1052 aa  806    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  58.07 
 
 
1050 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4338  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.07 
 
 
1050 aa  795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.107796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.78 
 
 
1042 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  51.11 
 
 
1049 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  60.33 
 
 
1053 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3498  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.88 
 
 
1056 aa  766    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3448  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.47 
 
 
1034 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0582  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.3 
 
 
1055 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.83 
 
 
1044 aa  822    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2965  aminoglycoside/multidrug efflux system  78.49 
 
 
1037 aa  1106    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  57.99 
 
 
1044 aa  782    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0997  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.26 
 
 
1042 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  56.95 
 
 
1048 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.93 
 
 
1044 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  55 
 
 
1075 aa  765    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3270  multidrug efflux protein  46.64 
 
 
1045 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.97 
 
 
1051 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.48 
 
 
1050 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1417  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.91 
 
 
1054 aa  810    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.77 
 
 
1053 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0254632  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3554  AcrB/AcrD/AcrF family protein  62.02 
 
 
1046 aa  835    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0860  inner membrane multidrug efflux protein BpeB  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.79 
 
 
1054 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1885  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  52.9 
 
 
1041 aa  707    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000188318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.74 
 
 
1032 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3318  cation efflux transporter  56.27 
 
 
1039 aa  732    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0288  acridine efflux pump  57.52 
 
 
1053 aa  777    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  58.46 
 
 
1063 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3398  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.18 
 
 
1048 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0526  RND multidrug efflux transporter MexB  60.89 
 
 
1046 aa  828    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0498  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.61 
 
 
1070 aa  803    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249321  normal  0.409358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  59.5 
 
 
1066 aa  802    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  57.76 
 
 
1047 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.23 
 
 
1053 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.97 
 
 
1049 aa  744    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.52 
 
 
1052 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.75 
 
 
1050 aa  767    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  60.09 
 
 
1066 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2446  inner membrane multidrug efflux protein BpeB  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.4 
 
 
1055 aa  783    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.42 
 
 
1048 aa  767    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.12 
 
 
1053 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  53.34 
 
 
1044 aa  717    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2065  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.26 
 
 
1052 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1871  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.57 
 
 
1046 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0328  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.85 
 
 
1050 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.218966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.42 
 
 
1039 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3842  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.71 
 
 
1048 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267176  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.41 
 
 
1059 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  60.39 
 
 
1069 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2837  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.37 
 
 
1055 aa  716    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143784  normal  0.226018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.85 
 
 
1057 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315153  normal  0.171354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.33 
 
 
1046 aa  791    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0611  inner membrane multidrug efflux protein BpeB  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.812364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3716  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.51 
 
 
1047 aa  799    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4250  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.57 
 
 
1044 aa  829    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3705  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.72 
 
 
1036 aa  852    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.508692 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1758  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.29 
 
 
1100 aa  758    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.04251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3494  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.75 
 
 
1036 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.67 
 
 
1050 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  58.22 
 
 
1048 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0091  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.04 
 
 
1044 aa  812    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0032  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.35 
 
 
1049 aa  809    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.79 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0059  inner membrane multidrug efflux protein BpeB  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215665  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.72 
 
 
1065 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.72 
 
 
1063 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2111  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.81 
 
 
1069 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0570882  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3799  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.82 
 
 
1053 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.83 
 
 
1044 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.83 
 
 
1044 aa  818    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.39 
 
 
1051 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0855  inner membrane multidrug efflux protein BpeB  59.94 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.35 
 
 
1066 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  60.74 
 
 
1046 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  47.09 
 
 
1045 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2313  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.22 
 
 
1042 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2966  acriflavine resistance protein B  61.31 
 
 
674 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101696  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0888  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.13 
 
 
1076 aa  763    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0636311  hitchhiker  0.000716366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.79 
 
 
1066 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0942  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.52 
 
 
1049 aa  868    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.87 
 
 
1065 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.72 
 
 
1063 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3679  acriflavin resistance protein  53.68 
 
 
1057 aa  744    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.441622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.8 
 
 
1041 aa  786    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.28 
 
 
1044 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.91 
 
 
1054 aa  818    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0776  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.79 
 
 
1055 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1781  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.68 
 
 
691 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250213  normal  0.743867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>