More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1938 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1938  exodeoxyribonuclease X  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.652538  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.47 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  61.47 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  61.47 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  61.47 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  61.01 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2415  exodeoxyribonuclease X  61.01 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  61.01 
 
 		 220 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  61.01 
 
 		 220 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  61.01 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  61.01 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  60.09 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  60.09 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  60.09 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  60.09 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  60.09 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  53.57 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.47 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.91 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6608  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.25 
 
 		 262 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0307436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0559  exonuclease  27.47 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1790  exonuclease  32.08 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.11 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0326  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.29 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.242447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  32.14 
 
 		 1444 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  30.95 
 
 		 1435 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1767  exodeoxyribonuclease X, putative  26.99 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1442  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.99 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0697655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  33.13 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  30.54 
 
 		 1433 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  29.94 
 
 		 1433 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.49 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  29.94 
 
 		 1433 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  33.14 
 
 		 1440 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  29.34 
 
 		 1433 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  28.74 
 
 		 970 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1066  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.67 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.327766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.95 
 
 		 578 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0908  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.8 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.06 
 
 		 1449 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0549  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.22 
 
 		 342 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.860226  hitchhiker  0.000115657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  31.06 
 
 		 1449 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  26.82 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 		 1436 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 		 1438 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3773  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.52 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 		 1438 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  35.03 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4910  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0387516  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5458  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  27.71 
 
 		 1426 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  26.64 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.52 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.52 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  28.57 
 
 		 1468 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  30 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  34.71 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  30.59 
 
 		 1464 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.33 
 
 		 1367 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  26.06 
 
 		 1402 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.33 
 
 		 1367 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 		 1443 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  27.65 
 
 		 1437 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.34 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.74 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  29.94 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.36 
 
 		 729 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2213  exonuclease  26.61 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.45 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  28.82 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  27.22 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.95 
 
 		 1433 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.58 
 
 		 769 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  27.22 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  31.1 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.6 
 
 		 909 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.14 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.73 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.68 
 
 		 610 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.18 
 
 		 921 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.22 
 
 		 1043 aa  55.8  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  26.83 
 
 		 1407 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>