25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1873 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1873  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.118537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0113  acetyltransferase  29.51 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1582  hypothetical protein  27.68 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106443  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2408  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1131  hypothetical protein  27.12 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1206  hypothetical protein  27.12 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0683  hypothetical protein  26.19 
 
 
247 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0783  hypothetical protein  26.38 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.82484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0643  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.489528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0779  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.398624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0772  acetyltransferase  23.76 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0926  acetyltransferase  27.87 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0870  acetyltransferase  27.42 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3667  acetyltransferase  23.2 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0866  acetyltransferase  24.44 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3358  acetyltransferase  25.82 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3476  acetyltransferase, GNAT family  23.2 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0748  acetyltransferase  26.92 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3545  acetyltransferase  23.2 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0768  acetyltransferase  25.28 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3255  acetyltransferase  25.28 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0867  acetyltransferase  24.86 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0012  acetyltransferase  24.66 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000388792  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2763  acetyltransferase  26.52 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>