46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1579 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1152  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.04 
 
 		 457 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0728  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.87 
 
 		 476 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1579  C4-dicarboxylate transporter DcuC  100 
 
 		 452 aa  892    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704309  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0668  C4-dicarboxylate transporter DcuC  84.1 
 
 		 461 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0313164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0644  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.41 
 
 		 461 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0173361  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0786  C4-dicarboxylate transporter DcuC  84.1 
 
 		 476 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026448  normal  0.816494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0742  C4-dicarboxylate transporter DcuC  84.1 
 
 		 476 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0709  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.64 
 
 		 461 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00726308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00580  hypothetical protein  83.41 
 
 		 461 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0640  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.18 
 
 		 461 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.907894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1292  C4-dicarboxylate transporter DcuC  84.86 
 
 		 450 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3039  C4-dicarboxylate transporter DcuC  85.08 
 
 		 450 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3004  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  83.41 
 
 		 461 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0682  C4-dicarboxylate transporter DcuC  84.1 
 
 		 476 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00591  anaerobic C4-dicarboxylate transport  83.41 
 
 		 461 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0536  C4-dicarboxylate transporter DcuC  82.59 
 
 		 461 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3023  C4-dicarboxylate transporter DcuC  83.18 
 
 		 461 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.780031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06095  C4-dicarboxylate transporter DcuC  63.05 
 
 		 455 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC  62.83 
 
 		 455 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.296544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0857  C4-dicarboxylate transporter DcuC  61.54 
 
 		 455 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510054  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0607  C4-dicarboxylate transporter DcuC  61.23 
 
 		 459 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1114  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.66 
 
 		 453 aa  338  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1194  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC  45.92 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03038  hypothetical protein  36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0593549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03087  predicted transporter  36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0479  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00235153  normal  0.454228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0479  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3522  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00146557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3709  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  34 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1816  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  37.39 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000187232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1207  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  34.25 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1391  cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD, authentic frameshift  31.25 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1820  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  34.17 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0278  anaerobic C4-dicarboxylate transporter, putative  31.25 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0673  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  30.79 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0051  putative C4-dicarboxylate transporter  31.44 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.211631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2073  orotate phosphoribosyltransferase (oprt) (oprtase)  25.81 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1378  putative C4-dicarboxylate transporter  26.06 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1244  C4-dicarboxylate ABC transporter permease  25.33 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0747  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  27.73 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  24.54 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  25.68 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.35 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.41 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  22.71 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  20.8 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>