More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0302 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  95.79 
 
 
451 aa  886    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0302  replicative DNA helicase  100 
 
 
451 aa  917    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  61.52 
 
 
455 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3747  replicative DNA helicase  61.2 
 
 
453 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0607  replicative DNA helicase  59.45 
 
 
453 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  55.76 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  56.43 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  55.76 
 
 
451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  55.76 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  54.73 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  54.5 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  55.98 
 
 
471 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  55.98 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  54.5 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  54.5 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  54.5 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  56.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  55.76 
 
 
467 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  53.38 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  53.38 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  55.76 
 
 
468 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  53.38 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  53.38 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  53.83 
 
 
468 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  55.3 
 
 
468 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  53.15 
 
 
468 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  55.3 
 
 
468 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  55.53 
 
 
474 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  53.15 
 
 
468 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  52.7 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  52.93 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  53.88 
 
 
466 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  52.86 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  51.8 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  53.45 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  54.05 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
465 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
465 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
465 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  50.23 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  51.86 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1531  DnaB helicase  51.7 
 
 
448 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498152  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
465 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  54.71 
 
 
465 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  52.87 
 
 
461 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  51.23 
 
 
472 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  51.12 
 
 
462 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  51.12 
 
 
478 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  49.22 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  49.22 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  51.73 
 
 
447 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  51.11 
 
 
472 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  53.66 
 
 
466 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  48.87 
 
 
464 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  52.49 
 
 
472 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  49.21 
 
 
463 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  53.06 
 
 
470 aa  425  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  49.44 
 
 
458 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58990  putative DNA helicase  50 
 
 
448 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144919  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  50.68 
 
 
461 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  48.75 
 
 
488 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1720  replicative DNA helicase  48.76 
 
 
458 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  51.24 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  48.78 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  51.46 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
476 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
463 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  51.24 
 
 
460 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
460 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
461 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
460 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1347  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
458 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  51.24 
 
 
460 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
460 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  50.55 
 
 
462 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
471 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
463 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>