18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1143 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1143  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000972481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1248  hypothetical protein  40.94 
 
 
258 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.591424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0687  hypothetical protein  41.57 
 
 
242 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0697  hypothetical protein  41.57 
 
 
242 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3690  hypothetical protein  41.57 
 
 
242 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0585  hypothetical protein  42.52 
 
 
248 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1348  hypothetical protein  49.04 
 
 
258 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00722512  decreased coverage  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3368  hypothetical protein  44.64 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0666  hypothetical protein  41.18 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3538  hypothetical protein  43.78 
 
 
248 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1156  hypothetical protein  44.98 
 
 
277 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766.1  hypothetical protein  42.58 
 
 
189 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3410  hypothetical protein  31.67 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2544  hypothetical protein  29.75 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33810  hypothetical protein  22.75 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3228  hypothetical protein  25.88 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3934  hypothetical protein  27.57 
 
 
250 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1207  hypothetical protein  24.39 
 
 
245 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>