22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5425 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  934    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  34.51 
 
 		 409 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  31.25 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  29.64 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  29.64 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  31.04 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  28.46 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  28.36 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  27.1 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  27.36 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  25.44 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  24.47 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  27.73 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  26.02 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  27.16 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  23.06 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  24.59 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  25.86 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  23.57 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  25.22 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  23.92 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  23.99 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>