81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2860 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
336 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2663  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
354 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0078  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
366 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  23.81 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  29.67 
 
 
322 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  28.78 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  29.67 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  29.67 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  23.49 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  29.17 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  23.17 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  23.17 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  23.17 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  26.58 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  24.32 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  27.42 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  27.42 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  26.81 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  26.72 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  23.63 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  25.7 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  26.72 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  29.66 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  30.16 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  23.7 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  30.7 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  26.72 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  24.88 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  23.81 
 
 
328 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2867  hypothetical protein  23.93 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.102761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  23.1 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  23.23 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2674  hypothetical protein  23.93 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0325383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  25.86 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  26.92 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  26.13 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  26.04 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  23.03 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  27.43 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0939  putative homoserine kinase type II  23.46 
 
 
396 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000121623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 
334 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  23.21 
 
 
334 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
324 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07750  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  46 
 
 
261 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.79134  normal  0.0827875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0129  aminoglycoside phosphotransferase  24.12 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  25.41 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0587  hypothetical protein  20.81 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
569 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  25 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0779  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  23.38 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  29.6 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  23.7 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  26.01 
 
 
321 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>