125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0047 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0030  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00179539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  94.83 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0024  tRNA-Met  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0016  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000151702  hitchhiker  0.0080631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0026  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000311751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0008  tRNA-Met  92.98 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0050  tRNA-Met  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000010044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2791  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000913036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2794  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2477  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00937631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2480  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0019483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0031  tRNA-Met  97.22 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0073  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0054  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0048  tRNA-Met  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565374  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1221  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1574  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1609  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.824013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0030  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0174  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0034  tRNA-Met  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.67 
 
 
80 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  91.67 
 
 
80 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0036  tRNA-Pro  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0614485  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0053  tRNA-OTHER  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0073  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  91.67 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0013  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.500451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0012  tRNA-Met  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000647679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0046  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0408586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>