More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0068 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0068  ABC transporter related protein  100 
 
 		 522 aa  975    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  26.13 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  24.53 
 
 		 609 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  26.44 
 
 		 574 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2045  transport ATP-binding protein CydD  25.52 
 
 		 574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  25.57 
 
 		 574 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2024  transport ATP-binding protein CydD  25.29 
 
 		 574 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.605538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  24.2 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  24.54 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  24.88 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  24.88 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  25.75 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  22.75 
 
 		 595 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1780  transport ATP-binding protein  24.36 
 
 		 574 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.17 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  25.5 
 
 		 609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  24.41 
 
 		 609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2985  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.87 
 
 		 618 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720786  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  25.05 
 
 		 597 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  23.66 
 
 		 609 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2598  ABC transporter related  20.87 
 
 		 618 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  25.17 
 
 		 609 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  24.15 
 
 		 574 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.28 
 
 		 612 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  30.81 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  25.36 
 
 		 603 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  23.43 
 
 		 622 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  23.55 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  23.41 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  21.93 
 
 		 621 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  25.05 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  22.22 
 
 		 636 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  23.87 
 
 		 609 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  23.26 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  23.81 
 
 		 569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  23.56 
 
 		 587 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  25.82 
 
 		 598 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02608  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.72 
 
 		 574 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  22.64 
 
 		 596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  24.37 
 
 		 609 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  25.6 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  25.17 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003746  transport ATP-binding protein CydC  28.21 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  23.68 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  23.37 
 
 		 609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  23.3 
 
 		 581 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  31.82 
 
 		 591 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  23.4 
 
 		 579 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  24.31 
 
 		 612 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  24.04 
 
 		 553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  24.45 
 
 		 618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.24 
 
 		 621 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  27.57 
 
 		 581 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  28.93 
 
 		 598 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  26.89 
 
 		 582 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.85 
 
 		 609 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  21.71 
 
 		 594 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  22.57 
 
 		 616 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  23.74 
 
 		 618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  20.3 
 
 		 962 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  21.25 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  21.25 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  20.81 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2601  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  22.01 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  23.23 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  22.08 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  19.27 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  23.46 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1606  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  22.01 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2689  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  22.01 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.64 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  22.75 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1715  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  26.24 
 
 		 579 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.989561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.51 
 
 		 610 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1652  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.02 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000177723  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  26.06 
 
 		 582 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  21.05 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  24.39 
 
 		 591 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.63 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  23.79 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  21.89 
 
 		 596 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  23.46 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  23.46 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  22.51 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  23.35 
 
 		 613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  21.13 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  18.67 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  22.74 
 
 		 599 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  21.31 
 
 		 610 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  21.7 
 
 		 611 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  22.69 
 
 		 638 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  20.68 
 
 		 610 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  24.56 
 
 		 870 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  22.73 
 
 		 610 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  22.15 
 
 		 571 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  25 
 
 		 606 aa  110  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  23.22 
 
 		 626 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  29.58 
 
 		 621 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  21.07 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>