More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0044 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.9 
 
 		 984 aa  747    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0044  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 900 aa  1781    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  44.3 
 
 		 1141 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  41.71 
 
 		 1183 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  42.79 
 
 		 1162 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1169 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  42.63 
 
 		 1162 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.56 
 
 		 1246 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1178 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.94 
 
 		 1165 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  40.9 
 
 		 1196 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  39.09 
 
 		 1265 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1150 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  41.8 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  42.11 
 
 		 1176 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 		 893 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  42.27 
 
 		 1176 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  43.97 
 
 		 1177 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1197 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  41.64 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  41.98 
 
 		 1165 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  38.2 
 
 		 893 aa  501  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  42.19 
 
 		 1168 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  40.41 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  41.38 
 
 		 1103 aa  499  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  42.19 
 
 		 1168 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1178 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1207 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  44.16 
 
 		 1244 aa  496  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  43.8 
 
 		 1177 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1183 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 		 1182 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  39.59 
 
 		 1159 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  44.83 
 
 		 1170 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1123 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  41.48 
 
 		 1170 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  41.52 
 
 		 1174 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  40.41 
 
 		 1154 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  39.93 
 
 		 1112 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  32.69 
 
 		 1099 aa  487  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  40.29 
 
 		 1197 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  40.6 
 
 		 1155 aa  485  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  43.64 
 
 		 1179 aa  485  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  38.86 
 
 		 1157 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  38.86 
 
 		 1157 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.13 
 
 		 1162 aa  484  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  41.33 
 
 		 1189 aa  485  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1148 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  41.19 
 
 		 1176 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  38.82 
 
 		 1158 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 		 901 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1169 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  43.72 
 
 		 1168 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.56 
 
 		 974 aa  474  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1271 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  39.83 
 
 		 1179 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  38.26 
 
 		 1116 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  40.53 
 
 		 1158 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  41.22 
 
 		 1145 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.61 
 
 		 1179 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  41.18 
 
 		 1198 aa  472  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1177 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1484  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1243 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.704172  normal  0.0864414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  38.88 
 
 		 1169 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  40.37 
 
 		 1158 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1161 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  38.16 
 
 		 1165 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1664  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1243 aa  469  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  41.5 
 
 		 1073 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1168 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  40.83 
 
 		 1149 aa  465  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1188 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  40.35 
 
 		 1151 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  40.33 
 
 		 1182 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  39.75 
 
 		 1188 aa  463  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  39.63 
 
 		 1157 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1149 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  38.76 
 
 		 1149 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  42.25 
 
 		 1153 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  42.25 
 
 		 1153 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1202 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1149 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  38.49 
 
 		 1147 aa  460  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  39.84 
 
 		 1164 aa  462  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  39.72 
 
 		 1059 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  39.28 
 
 		 1155 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1141 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  36.99 
 
 		 1179 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  39.28 
 
 		 1103 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  38.65 
 
 		 1157 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  39.58 
 
 		 1176 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  38.8 
 
 		 1127 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1224 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  39.29 
 
 		 1172 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>