More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0001 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0001  Chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 
441 aa  882    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.94 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.99 
 
 
450 aa  231  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.74 
 
 
456 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.65 
 
 
443 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
481 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.31 
 
 
463 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.68 
 
 
453 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  32.73 
 
 
441 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.29 
 
 
454 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.34 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.67 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.59 
 
 
444 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.77 
 
 
450 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  35.89 
 
 
483 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  35.11 
 
 
480 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
446 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  36.05 
 
 
436 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.09 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  35.09 
 
 
472 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
440 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  36.28 
 
 
453 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 
442 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.28 
 
 
453 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  35.57 
 
 
450 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 
451 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.4 
 
 
439 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.09 
 
 
457 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.54 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
446 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 
446 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
468 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.24 
 
 
503 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  34.95 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  35.83 
 
 
473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  35.83 
 
 
473 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  37.04 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  35.51 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  29.58 
 
 
454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.7 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.25 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  35.07 
 
 
460 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  34.12 
 
 
443 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
476 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  34.87 
 
 
494 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.14 
 
 
509 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 
452 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 
452 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.26 
 
 
587 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.56 
 
 
652 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.58 
 
 
464 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.789649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  34.87 
 
 
492 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.26 
 
 
591 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  34.94 
 
 
465 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.17 
 
 
465 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.86 
 
 
480 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.22 
 
 
453 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.63 
 
 
470 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  34.77 
 
 
478 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.4 
 
 
472 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  35.17 
 
 
462 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  33.6 
 
 
461 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
462 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  34.49 
 
 
468 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
468 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  37.81 
 
 
443 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
483 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.51 
 
 
527 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
464 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
466 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
467 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
466 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
466 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  34.17 
 
 
462 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
451 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
466 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  34.11 
 
 
468 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
466 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 
449 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
462 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
462 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 
464 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 
460 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
461 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>