12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4504 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4504  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0629  hypothetical protein  80.56 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4131  hypothetical protein  70.15 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0473  hypothetical protein  73.53 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2623  hypothetical protein  52.78 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6196  hypothetical protein  55.88 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282179  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0084  hypothetical protein  63.77 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.761061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2078  hypothetical protein  60.29 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0076  hypothetical protein  63.64 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3487  hypothetical protein  55.74 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  0.658702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2300  hypothetical protein  61.19 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2067  hypothetical protein  47.76 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>