More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2074 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2882  cell division protein FtsZ  74.06 
 
 
619 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2845  cell division protein FtsZ  77.39 
 
 
572 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287713  hitchhiker  0.00902065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2586  cell division protein FtsZ  76.85 
 
 
571 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0982518  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2074  cell division protein FtsZ  100 
 
 
590 aa  1181    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.813206  hitchhiker  0.00137674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1425  cell division protein FtsZ  66.72 
 
 
566 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1382  cell division protein FtsZ  66.72 
 
 
566 aa  611  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2001  cell division protein FtsZ  66.67 
 
 
552 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000263302  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1750  cell division protein FtsZ  66.83 
 
 
565 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000567765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0941  cell division protein FtsZ  55.09 
 
 
592 aa  511  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0698  cell division protein FtsZ  56.31 
 
 
610 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.591977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1286  cell division protein FtsZ  55.57 
 
 
607 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7436  cell division protein FtsZ  55.42 
 
 
606 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0328  cell division protein FtsZ  86.88 
 
 
590 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126333  normal  0.436699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3495  cell division protein FtsZ  56.81 
 
 
569 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.417805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1058  cell division protein FtsZ  82.39 
 
 
603 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154348  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3298  cell division protein FtsZ  82.87 
 
 
592 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4040  cell division protein FtsZ  82.24 
 
 
591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6166  cell division protein FtsZ  82.55 
 
 
610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2004  cell division protein FtsZ  82.55 
 
 
597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.298941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3386  cell division protein FtsZ  81.93 
 
 
595 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.631027  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6697  cell division protein FtsZ  83.44 
 
 
616 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2350  cell division protein FtsZ  81.88 
 
 
586 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3176  cell division protein FtsZ  81.88 
 
 
585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0782818  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3133  cell division protein FtsZ  81.88 
 
 
588 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.169763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2949  cell division protein FtsZ  81.88 
 
 
585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0151858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2427  cell division protein FtsZ  53.34 
 
 
591 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000809973  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4487  cell division protein FtsZ  67.11 
 
 
544 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1943  cell division protein FtsZ  73.73 
 
 
345 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2416  cell division protein FtsZ  50.25 
 
 
531 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147556  normal  0.595095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3657  cell division protein FtsZ  67.91 
 
 
504 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2114  cell division protein FtsZ  67.47 
 
 
552 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0790  cell division protein FtsZ  67.47 
 
 
552 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2070  cell division protein FtsZ  74.06 
 
 
543 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  0.358152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1139  cell division protein FtsZ  66.77 
 
 
491 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0700  cell division protein FtsZ  73.37 
 
 
551 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.502666  normal  0.627265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2172  cell division protein FtsZ  72.7 
 
 
513 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0335477  normal  0.0236284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1875  cell division protein FtsZ  70.81 
 
 
482 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.487972  normal  0.232023 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0925  cell division protein FtsZ  67.16 
 
 
420 aa  393  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0116  cell division protein FtsZ  74.59 
 
 
317 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.138095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2285  cell division protein FtsZ  74.52 
 
 
340 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3940  cell division protein FtsZ  68.04 
 
 
495 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2618  cell division protein FtsZ  73.57 
 
 
339 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12624  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1153  cell division protein FtsZ  68.28 
 
 
421 aa  378  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.872547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3164  cell division protein FtsZ  61.33 
 
 
479 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.972312 
 
 
-
 
NC_002978  WD0723  cell division protein FtsZ  66.57 
 
 
398 aa  372  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0809935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0069  cell division protein FtsZ  64.29 
 
 
522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0944  cell division protein FtsZ  69.35 
 
 
665 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0342  cell division protein FtsZ  60.27 
 
 
372 aa  330  3e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.000000128009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2874  Cell division GTPase-like protein  45.27 
 
 
468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0751  cell division protein FtsZ  57.38 
 
 
424 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6104  cell division protein FtsZ  56.91 
 
 
395 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530427  normal  0.0566942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2003  cell division protein FtsZ  56.76 
 
 
357 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00598535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2782  cell division protein FtsZ  54.05 
 
 
391 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000504391  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0305  cell division protein FtsZ  54.46 
 
 
399 aa  298  3e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4057  cell division protein FtsZ  57.79 
 
 
353 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2064  cell division protein FtsZ  55.05 
 
 
380 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000128315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5214  cell division protein FtsZ  56.17 
 
 
587 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.945677  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1012  cell division protein FtsZ  57 
 
 
462 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0217223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10840  cell division protein FtsZ  51.71 
 
 
439 aa  294  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.084268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3196  cell division protein FtsZ  54.17 
 
 
476 aa  292  9e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00948897  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1410  cell division protein FtsZ  52.48 
 
 
500 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.459708  normal  0.052876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3894  cell division protein FtsZ  49.05 
 
 
405 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.245773 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2498  cell division protein FtsZ  43.16 
 
 
430 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.103789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0747  cell division protein FtsZ  51.64 
 
 
432 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100663  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1489  cell division protein FtsZ  50.9 
 
 
358 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.457211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1287  cell division protein FtsZ  51.75 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2643  cell division protein FtsZ  49.58 
 
 
382 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3757  cell division protein FtsZ  54.14 
 
 
363 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0445  cell division protein FtsZ  56.4 
 
 
376 aa  290  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000149361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3766  cell division protein FtsZ  49.42 
 
 
423 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0240181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27370  cell division protein FtsZ  56.42 
 
 
438 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5760  cell division protein FtsZ  52 
 
 
404 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16540  cell division protein FtsZ  56.31 
 
 
415 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0315962 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  46.24 
 
 
427 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1598  cell division protein FtsZ  51.69 
 
 
426 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.568478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2923  cell division protein FtsZ  56.31 
 
 
494 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3264  cell division protein FtsZ  53.44 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0044475  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3259  cell division protein FtsZ  56.31 
 
 
430 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0900  cell division protein FtsZ  48.45 
 
 
498 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0850  cell division protein FtsZ  56.31 
 
 
355 aa  288  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000127363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3253  cell division protein FtsZ  53.44 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3315  cell division protein FtsZ  53.44 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1064  cell division protein FtsZ  54.37 
 
 
353 aa  287  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1077  cell division protein FtsZ  53.33 
 
 
440 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2018  cell division protein FtsZ  54.76 
 
 
381 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000169296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1735  cell division protein FtsZ  54.76 
 
 
381 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000316509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0497  cell division protein FtsZ  51.52 
 
 
386 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000633261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0514  cell division protein FtsZ  51.52 
 
 
386 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1574  cell division protein FtsZ  56.9 
 
 
415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.253808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1573  cell division protein FtsZ  56.57 
 
 
407 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12180  cell division protein FtsZ  55.97 
 
 
379 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0049018  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13570  cell division protein FtsZ  56.95 
 
 
398 aa  284  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.264332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3520  cell division protein FtsZ  55.63 
 
 
388 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231533  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3436  cell division protein FtsZ  55.63 
 
 
372 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3210  cell division protein FtsZ  55.63 
 
 
371 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  45.4 
 
 
420 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1113  cell division protein FtsZ  55.97 
 
 
469 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.817841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2407  cell division protein FtsZ  57 
 
 
408 aa  283  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2991  cell division protein FtsZ  55.63 
 
 
392 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.89492  normal  0.023391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1288  cell division protein FtsZ  48.16 
 
 
379 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.848235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>