34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1080 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343448  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  54.36 
 
 
195 aa  210  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1800  GCN5-related N-acetyltransferase  54.4 
 
 
193 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313237  hitchhiker  0.00103766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1607  GCN5-related N-acetyltransferase  52.85 
 
 
193 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3674  acetyltransferase  27.96 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2743  acetyltransferase  27.33 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3010  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.634781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
310 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2150  acetyltransferase  23.26 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000318542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1761  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  41.67 
 
 
222 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  37.5 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0836  acetyltransferase  30.1 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.312661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2136  acetyltransferase, GNAT family  27.08 
 
 
171 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1923  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4862  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0422  acetyltransferase  23.08 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  26.32 
 
 
170 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3112  acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.53 
 
 
149 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2895  acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.425529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3133  acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  26.32 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>