81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0947 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0947  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
167 aa  347  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1723  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 
166 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158743  normal  0.281229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  64.02 
 
 
167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1782  acetyltransferase  57.93 
 
 
172 aa  215  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.576459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
167 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0897  acetyltransferase  40.24 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0900  acetyltransferase  40.24 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0250  acetyltransferase  31.43 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.416446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0640  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  23.35 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  26.06 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  26.06 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  26.06 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  26.06 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  26.06 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  26.06 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  26.06 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  26.06 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  25.69 
 
 
161 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  23.72 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1798  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.97 
 
 
156 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  25.32 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2172  GCN5-related N-acetyltransferase  23.74 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1731  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.7 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1869  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.11 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  27.69 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  25.52 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  31.91 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  25 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5777  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  34 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4930  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  22.66 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0910  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329929  normal  0.100371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0847  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1635  acetyltransferase  23.49 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.964206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3357  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.58 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.855174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  23.65 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.246804  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1396  30S ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.91 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
147 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
160 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
147 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000002184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.93 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
155 aa  41.2  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
188 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2721  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1154  histone acetyltransferase  30.77 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>