More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0120 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  66.87 
 
 
495 aa  646    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  70.85 
 
 
493 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  70.65 
 
 
493 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
494 aa  973    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.55 
 
 
497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  63.02 
 
 
496 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  63.02 
 
 
496 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  54.14 
 
 
489 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  56.53 
 
 
483 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  55.42 
 
 
486 aa  488  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.6 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.01 
 
 
480 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  53.01 
 
 
492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.71 
 
 
481 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  52.51 
 
 
481 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1072  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  49.48 
 
 
459 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.335242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.49 
 
 
464 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  69.97 
 
 
396 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  49.48 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3754  phosphate ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1232  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.88 
 
 
462 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.68269  normal  0.54486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.75 
 
 
459 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.68 
 
 
460 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.79 
 
 
462 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4550  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.38 
 
 
480 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  46.43 
 
 
460 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  46.03 
 
 
468 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.99 
 
 
566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0825  phosphate ABC transporter permease  46.23 
 
 
458 aa  356  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  53.24 
 
 
414 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0465  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.81 
 
 
410 aa  326  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.870192  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.1 
 
 
414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  50.87 
 
 
418 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.92 
 
 
413 aa  315  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1858  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.09 
 
 
418 aa  310  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.85 
 
 
409 aa  299  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392493  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0982  phosphate ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 
374 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72351  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0145  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.36 
 
 
374 aa  254  3e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00254182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.95 
 
 
304 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  44.66 
 
 
295 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.71 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.73 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.59 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.57 
 
 
319 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.33 
 
 
306 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  41.16 
 
 
302 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.23 
 
 
311 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  42.49 
 
 
310 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0800  phosphate ABC transporter, permease protein  43.14 
 
 
304 aa  237  4e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.33 
 
 
310 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0717  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  42.81 
 
 
304 aa  236  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0643  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  42.81 
 
 
304 aa  236  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1055  putative phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.16 
 
 
304 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.17 
 
 
308 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  41.42 
 
 
311 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.36 
 
 
315 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.5 
 
 
320 aa  230  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.92 
 
 
307 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  41.42 
 
 
310 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.08 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.08 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  41.42 
 
 
320 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.39 
 
 
309 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.39 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  44.1 
 
 
308 aa  223  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.26 
 
 
315 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.82 
 
 
316 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.76 
 
 
315 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 
316 aa  220  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.46 
 
 
307 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  39.87 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  39.87 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.58 
 
 
343 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.91 
 
 
313 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  39.56 
 
 
316 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  39.55 
 
 
313 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 
316 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
316 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  39.24 
 
 
316 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.64 
 
 
350 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
325 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.09 
 
 
316 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.93 
 
 
357 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.95 
 
 
324 aa  206  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.482233  normal  0.348466 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0204  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.06 
 
 
324 aa  204  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00435822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.68 
 
 
310 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  36.86 
 
 
298 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.73 
 
 
324 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.54 
 
 
291 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.87 
 
 
290 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.82 
 
 
292 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.23 
 
 
291 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.06 
 
 
297 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.02 
 
 
296 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.71 
 
 
297 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.7 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.28 
 
 
291 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  35.37 
 
 
297 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>