10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0060 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281057  normal  0.443419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0077  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0293973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0475  hypothetical protein  36.55 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1349  hypothetical protein  31.98 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1032  hypothetical protein  29.44 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0973  hypothetical protein  28.72 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0390  hypothetical protein  29.19 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4746  hypothetical protein  29.44 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0265  hypothetical protein  28.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>