137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4015 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05437  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  62.51 
 
 
1137 aa  1211    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4015  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1114 aa  2189    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.268037 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1815  exodeoxyribonuclease V gamma chain  60.04 
 
 
1121 aa  1204    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  60.13 
 
 
1121 aa  1204    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.632036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.34 
 
 
1091 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.51 
 
 
1085 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.24 
 
 
1074 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.39 
 
 
1071 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.32 
 
 
1068 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.03 
 
 
1061 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  31.02 
 
 
1123 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.03 
 
 
1187 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  30.39 
 
 
1128 aa  406  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.54 
 
 
1054 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  28.93 
 
 
1164 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  29.66 
 
 
1122 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.18 
 
 
1190 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  29.48 
 
 
1122 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.57 
 
 
1122 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  29.48 
 
 
1122 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  30.03 
 
 
1123 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  29.48 
 
 
1122 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  29.57 
 
 
1122 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  29.57 
 
 
1122 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  29.31 
 
 
1122 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  29.04 
 
 
1163 aa  393  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  29.86 
 
 
1123 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  29.4 
 
 
1122 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.64 
 
 
1075 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.66 
 
 
1184 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  28.78 
 
 
1124 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  29.75 
 
 
1148 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  29.86 
 
 
1123 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  29.88 
 
 
1132 aa  386  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  29.68 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  29 
 
 
1123 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.71 
 
 
1173 aa  386  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  29.13 
 
 
1123 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  28.78 
 
 
1127 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.78 
 
 
1127 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  29.13 
 
 
1123 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  29.13 
 
 
1123 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  29.56 
 
 
1123 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.02 
 
 
1192 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.6 
 
 
1131 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.47 
 
 
1077 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  34.09 
 
 
1171 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.94 
 
 
1226 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.78 
 
 
1269 aa  373  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.57 
 
 
1164 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  28.25 
 
 
1260 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.25 
 
 
1260 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.24 
 
 
1077 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.57 
 
 
1160 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.57 
 
 
1160 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.9 
 
 
1060 aa  362  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.47 
 
 
1270 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.64 
 
 
1274 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.68 
 
 
1236 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.63 
 
 
1158 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.68 
 
 
1234 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.94 
 
 
1234 aa  356  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.31 
 
 
1270 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.85 
 
 
1149 aa  356  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.3 
 
 
1158 aa  354  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.45 
 
 
1158 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.15 
 
 
1159 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.99 
 
 
1270 aa  349  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.46 
 
 
1163 aa  349  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.49 
 
 
1157 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.79 
 
 
1197 aa  346  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.39 
 
 
1064 aa  346  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  32.96 
 
 
1156 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.42 
 
 
1150 aa  343  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.61 
 
 
1098 aa  342  2e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.38 
 
 
1166 aa  335  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.69 
 
 
1168 aa  335  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.94 
 
 
1375 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.45 
 
 
1206 aa  326  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.2 
 
 
1183 aa  325  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.92 
 
 
1270 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.1 
 
 
1162 aa  313  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4569  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.7 
 
 
1169 aa  309  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.14 
 
 
1138 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.08 
 
 
1198 aa  293  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1168  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.49 
 
 
1210 aa  288  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2931  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.02 
 
 
1130 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.34 
 
 
1144 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2546  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.02 
 
 
1130 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0520  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.69 
 
 
1174 aa  281  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.318804  normal  0.0360548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.71 
 
 
1294 aa  279  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1849  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.03 
 
 
1218 aa  270  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.013439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.02 
 
 
1063 aa  258  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.81 
 
 
1103 aa  244  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.19 
 
 
1143 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.14 
 
 
1158 aa  241  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.04 
 
 
1113 aa  235  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.41 
 
 
1082 aa  235  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.41 
 
 
1082 aa  235  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.56 
 
 
1080 aa  234  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>