206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3638 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3638  Alkaline phosphatase  100 
 
 
515 aa  1058    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  47.36 
 
 
497 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  36.26 
 
 
631 aa  243  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  36.68 
 
 
521 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  35.12 
 
 
615 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
2701 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  27.22 
 
 
945 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  28.89 
 
 
2182 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  27.33 
 
 
1587 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  28.24 
 
 
559 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  30.52 
 
 
525 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3159  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 
571 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0625023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28.53 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  28.5 
 
 
530 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
543 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  30.72 
 
 
525 aa  97.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  26.37 
 
 
388 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  26.85 
 
 
455 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  29.39 
 
 
434 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.23 
 
 
3977 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  27.75 
 
 
455 aa  94  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  24.83 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.25 
 
 
2852 aa  90.9  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  28.48 
 
 
537 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  26.87 
 
 
492 aa  90.1  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  26.38 
 
 
454 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  29.77 
 
 
554 aa  87.8  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  27.04 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49678  predicted protein  25.53 
 
 
729 aa  87  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  26.92 
 
 
481 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  27.03 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  27.59 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  30.16 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  29.91 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  29.91 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
471 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  25.12 
 
 
474 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  25.12 
 
 
474 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  25.34 
 
 
461 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  29.57 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  29.68 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2010  Alkaline phosphatase  32.52 
 
 
627 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.208798  normal  0.40879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1983  Alkaline phosphatase  32.52 
 
 
627 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  26.26 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  27.7 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  26.86 
 
 
689 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  26.26 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  26.03 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  25.68 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  26.26 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  29.24 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  25.92 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  26.03 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  27 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  25.63 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  26.03 
 
 
461 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  26.03 
 
 
461 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
518 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  25.27 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  26.87 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  26.16 
 
 
467 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  29.67 
 
 
464 aa  77  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  26.37 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  28.81 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  23.36 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  26.04 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  24.42 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  35.26 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  27.16 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  23.68 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  27.6 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  23.79 
 
 
557 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  23.79 
 
 
557 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  23.79 
 
 
557 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  25.83 
 
 
501 aa  73.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  35.53 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  35.26 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  26.77 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  35.53 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  23.15 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  35.53 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  35.53 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  25.76 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  24.91 
 
 
589 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  28.02 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  24.92 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  23.29 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  26.01 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  25.88 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  34.92 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  34.92 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>