273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2302 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2302  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.152451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  36.84 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  35.47 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.54 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  36.51 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  38.61 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  35.37 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  34.17 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  33.23 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  33.76 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  34.38 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  34.06 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  32.9 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.31 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  35.4 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  34.41 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 353 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  33.33 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  33.9 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.23 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.6 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  38.97 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  34.63 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  32.38 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  30.7 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.08 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  34.8 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.85 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  29.26 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  30.63 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  32.6 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.54 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  31.63 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  31.63 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30.62 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.61 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  31.25 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.97 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  30.16 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.23 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  29.84 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.87 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  33.57 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.53 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  28.53 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  28.53 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  28.53 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  32.15 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.46 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  31.68 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  28.53 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.94 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  34.5 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  31.33 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  32.55 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.13 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  29.49 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  36.28 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  30.94 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  32.39 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.01 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  32.39 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  32.39 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  31.6 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.39 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.39 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>