36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2095 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2095  NUDIX hydrolase  100 
 
 
356 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.390831  decreased coverage  0.00754361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.51 
 
 
149 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
149 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  30.19 
 
 
149 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
149 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.13 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
140 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
203 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
148 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
155 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
144 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  37.68 
 
 
137 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
144 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
206 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  40 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
135 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
226 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  28.72 
 
 
149 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 
168 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  28.72 
 
 
153 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
141 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
208 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
149 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
143 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
143 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3145  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 
251 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.087939  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
140 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
149 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
149 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  26.6 
 
 
148 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
149 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
149 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>