More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6469 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6469  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
573 aa  1195    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
445 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  39.88 
 
 
436 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
424 aa  101  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 
481 aa  101  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 
481 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  28.98 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  35.47 
 
 
489 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 
485 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  37.58 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
487 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  29.9 
 
 
494 aa  97.8  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  30.22 
 
 
487 aa  97.8  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  28.88 
 
 
479 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
486 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 
268 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.48 
 
 
487 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
529 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.74 
 
 
490 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
489 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
489 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 
605 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  32.79 
 
 
486 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.48 
 
 
487 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.48 
 
 
487 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.48 
 
 
487 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.48 
 
 
487 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 
493 aa  94  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.48 
 
 
487 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
282 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  31.55 
 
 
267 aa  93.2  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  34.39 
 
 
262 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.91 
 
 
289 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.5 
 
 
494 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 
474 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
284 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
489 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  36.75 
 
 
264 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.09 
 
 
265 aa  91.7  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 
569 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
490 aa  91.3  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.54 
 
 
432 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.5 
 
 
483 aa  91.3  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29.73 
 
 
487 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 
524 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.73 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.9 
 
 
427 aa  90.9  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.19 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.19 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.73 
 
 
487 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
479 aa  90.5  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
486 aa  90.5  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 
500 aa  90.5  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 
487 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
271 aa  90.5  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.02 
 
 
561 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.19 
 
 
487 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 
487 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
567 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.99 
 
 
474 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.29 
 
 
294 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.83 
 
 
484 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
271 aa  88.6  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  30.34 
 
 
272 aa  88.6  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  33.14 
 
 
489 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
365 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 
493 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  34.32 
 
 
573 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
470 aa  87  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.48 
 
 
480 aa  87.4  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  38.24 
 
 
268 aa  87  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
447 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  36.55 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 
284 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.41 
 
 
479 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 
275 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  35.71 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.46 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>